Titular por três anos no gol do Corinthians, o goleiro Felipe foi um dos principais nomes do Timão para a reconstrução do clube após a queda para a Série B em 2007, onde o arqueiro foi um dos únicos a serem mantidos no Alvinegro Paulista.
Tendo passado por todas as categorias de base do Brasil, Felipe iniciou sua carreira nas divisões de base do Vitória em 2002. Ele permaneceu no time baiano até 2006, geralmente atuando como reserva. Após breves passagens por São Caetano e Portuguesa, ele chegou ao Bragantino. Em 2007, teve uma ótima campanha com a equipe de Bragança, chegando até as semifinais.
As boas atuações do goleiro chamaram a atenção do Corinthians, que o contratou ao término do campeonato. Felipe foi titular na maior parte do Brasileirão de 2007 e, apesar da campanha desfavorável da equipe, teve performances notáveis. Ele até mesmo foi indicado para os prêmios de melhor goleiro e revelação do campeonato.
Em 2008, destacou-se novamente na trajetória do vice-campeonato da Copa do Brasil e na conquista do título da Série B. Suas atuações consistentes persistiram em 2009, contribuindo para a conquista de dois troféus importantes: o Paulista de forma invicta e a Copa do Brasil.
Na temporada de 2010, durante a pausa para a Copa do Mundo, Felipe solicitou sua transferência. Isso causou um grande desconforto com o presidente Andrés Sanchez, levando o jogador a ser afastado do elenco até que a negociação fosse concretizada. Em agosto, ele se transferiu para o Braga, de Portugal.
Felipe ainda voltou ao Brasil, onde defendeu o Flamengo, Figueirense, novamente o Braga, Boa Vista-RJ e o Uberlândia antes de ir para o futebol húngaro, no Kisvárda. Em 2020, o arqueiro retornou ao futebol canarinho onde atuou pelo Botafogo-PB, Taubaté, Paraná, Capital-DF, e, atualmente, defende as cores do Santa Rosa, do Pará.
Ao todo, pelo clube do Parque São Jorge, foram 194 jogos, com 100 vitórias, 56 empates e 38 derrotas. Felipe conquistou o título do Brasileirão Série B, Campeonato Paulista 2009 e Copa do Brasil 2009.
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